我国建成世界首个水稻基因索引数据库
2023-04-13 21:27:59 科技日报


【资料图】

科技日报武汉4月12日电(蒋朝常 记者吴纯新)记者12日从华中农业大学获悉,该校张建伟教授课题组联合国内外高校与科研团队,以代表亚洲稻群体结构的高质量基因组为对象,构建并全面分析基因组倒位图谱,建成了世界上首个基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。相关研究成果发表在《自然·通讯》与《分子植物》。

亚洲栽培稻是世界一半人口的主食。预计2060年至2070年,世界人口数量将增加到约100亿,科研人员迫切需要培育产量高、营养丰富、绿色环保和气候适应性更强的新品种。

张建伟介绍,全球有约500万份水稻种质及其野生近缘种,这些资源的基因组变异中(单核苷酸多态性、插入缺失、倒位和易位等)蕴藏着品种改良的重要信息,对其开展基于泛基因组的多组学研究具有重要意义。

水稻基因索引数据库可为每个水稻基因建立一张“综合图文信息卡片”,实现不同功能和常用数据库之间的快速链接,记录包括OGI、基因通用名、序列、功能、表达等基本信息,并以可交互示意图展示该基因转录本结构、可变剪接事件、同源关系网络图和系统发育树等。

该平台能为用户提供丰富的模块和工具,方便研究人员对不同种质基因以及基因同源关系进行查询、分析和可视化,为全球水稻研究学者提供免费在线检索和分析服务。研究人员可以通过关键词、序列、同源关系等3种方式在数据库中进行搜索,并在微观和宏观尺度对种质间基因组共线性进行分析和可视化研究。

热门推荐

文章排行

  1. 2023-04-13我国建成世界首个水稻基因索引数据库
  2. 2023-04-13每日视点!人民日报9句话:暴露了当下社会最好的生活方式(建议收藏)
  3. 2023-04-13世界热点!股市:大单买入,股价不断下跌?实战跟庄技巧,看懂就是赚到!
  4. 2023-04-13云鼎科技:一季度净利预增804.83%_环球视点
  5. 2023-04-13报道:曾经装修“颜值至上”,对收纳功能微改造后,146㎡美式复古风的家藏起杂物重拾氛围感|周到来敲门①
  6. 2023-04-13表彰!福建3个集体、35名个人榜上有名 天天最资讯
  7. 2023-04-13环球关注:赛升药业:安牛生物是公司利用分子生物学的技术优势在生物经济产业的拓展,与公司战略发展具有协同作用
  8. 2023-04-13给明星点赞就能挣钱?女子深信不疑被骗19万余元
  9. 2023-04-13产业群策群力推动PC低碳转型 中国电子学会绿色计算机标准工作组宣布成立
  10. 2023-04-13【当前独家】庞巴迪BRP骑行学院与福特F-150猛禽征途学院官宣合作
  11. 2023-04-13安徽省470个村落列入中国传统村落保护名录
  12. 2023-04-13大语言模型中的涌现现象是不是伪科学?
  13. 2023-04-13全球观点:乡村振兴公益培训:这是一场赋能充电的及时雨
  14. 2023-04-13成立为老服务联盟、发布“四季为老服务项目”…周家桥街道不断扩大“幸福养老生活圈”
  15. 2023-04-13全球热点评!埃尔马斯:主裁判对我们什么都吹,米兰犯规很多但都没吃牌
  16. 2023-04-13鹿鼎记2神龙教国语高清优酷_鹿鼎记2神龙教国语高清迅雷下载
  17. 2023-04-13世界快看:谁晋级?皇马、切尔西连续3年欧冠淘汰赛相遇,此前胜者均夺冠
  18. 2023-04-13农业建筑环境与能源工程属于哪类_农业建筑环境与能源工程
  19. 2023-04-12我的小猫不会喵喵叫 | 小黑_环球即时
  20. 2023-04-12环球关注:男子车辆逾期未检被拦下,武汉洪山交警一查:居然还是无证醉驾!